對於 Adapter-on 的基因片段,我們會將通用 adapter 合成至每個片段的兩端。adapter 長度為 21-22 個核苷酸。具有這些 adapter 的片段與多種組裝方法兼容,即 Restriction digestion/Ligation、Gateway、Golden Gate 和 TOPO cloning。
通過在 adapter 內部添加限制酶切位可移除 adapter。 TOPO 克隆將發揮作用,但 adapter 會保持打開狀態。
Adapter Sequences
2021 年 8 月 9 日之前收到的訂單,adapter序列如下:
5′ Adapter :GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT
3′ Adapter :AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG
5′ – GAAGTGCCATTCCGCCTGACCT – 插入片段 – AGGCTAGGTGGAGGCTCAGTG – 3′
2021 年 8 月 9 日至2021 年 11 月 1 日收到的訂單,adapter 序列如下:
5′ Adapter :CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT
3′ Adapter :AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG
5′ – CCCCGTCACCTTTGGCTTATCAGT – 插入片段 – AGTGACATCTGGACGCTAAGACCG – 3′
2021 年 11 月 2 日及之後收到的訂單,adapter 序列如下:
5′ Adapter :CAATCCGCCCTCACTACAACCG
3′ Adapter :CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA
5′ – CAATCCGCCCTCACTACAACCG – 插入片段 – CTACTCTGGCGTCGATGAGGGA – 3’
*Adapter 是添加到插入片段兩端的短序列,該添加步驟是我們合成過程的一部分。也可以選擇不含這些 adapter 的基因片段 ,亦即 Adapter-off。